SR熒光顯微鏡在生物學(xué)研究中的應(yīng)用
更新時(shí)間:2019-05-15 點(diǎn)擊次數(shù):1401
到目前為止,人們還很難得知,SR熒光顯微鏡會(huì)對(duì)生物學(xué)界的哪一個(gè)領(lǐng)域帶來(lái)重大變革,但已經(jīng)有幾個(gè)領(lǐng)域出現(xiàn)了明顯的改變。這些研究領(lǐng)域是動(dòng)態(tài)及靜態(tài)的細(xì)胞組織結(jié)構(gòu)研究領(lǐng)域、非均質(zhì)分子組織研究領(lǐng)域、蛋白動(dòng)態(tài)組裝研究領(lǐng)域等。這幾個(gè)領(lǐng)域都有一個(gè)共同的特點(diǎn),那就是它們研究的重點(diǎn)都是分子間如何相互作用、組裝形成復(fù)合物。因此,能在納米水平觀察這些分子對(duì)它們來(lái)說(shuō)具有重大的意義。
通過(guò)觀察蛋白質(zhì)之間的組合關(guān)系來(lái)了解它們的作用,并能為后續(xù)的細(xì)胞功能試驗(yàn)打下基礎(chǔ)
結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究在這方面已經(jīng)取得了很大的進(jìn)展,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了4-8納米大小的分子間相互作用組裝成細(xì)胞微管、肌絲、中間絲這些超過(guò)10微米大小聚合物的機(jī)制。不過(guò)對(duì)于核孔復(fù)合體、中心體、著絲點(diǎn)、中間體、粘著斑這些由許多不同蛋白經(jīng)過(guò)復(fù)雜的三維組裝方式組合起來(lái)的復(fù)合體,還需要更好的辦法來(lái)進(jìn)行研究。目標(biāo)就是要達(dá)到分子水平的分辨率,這樣就可以觀察大復(fù)合體形成過(guò)程中的單個(gè)分子,也就能對(duì)這些分子的化學(xué)計(jì)量學(xué)有所了解了。要得到更多的生物學(xué)信息就需要SR顯微鏡這樣的三維成像技術(shù),例如可以使用活體細(xì)胞SR成像捕捉細(xì)胞骨架的動(dòng)態(tài)重構(gòu)過(guò)程等等。
SR成像有助于人們更好地了解分子間的差異
細(xì)胞膜蛋白組織方式的經(jīng)典模型已經(jīng)從隨機(jī)分布的液態(tài)鑲嵌模型轉(zhuǎn)變成了脂筏模型、穴樣內(nèi)陷模型或特殊蛋白模型。這種差異與細(xì)胞不同功能相關(guān),例如在高爾基體、cargo蛋白和高爾基體酶蛋白之間必須發(fā)生相互作用,但終它們會(huì)按照各自的功能分開,發(fā)揮各自的作用。有很多試驗(yàn)手段,例如免疫電鏡技術(shù)、熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù)(FRET)等都已經(jīng)被用來(lái)研究這種膜不均一性問(wèn)題了。多色PALM技術(shù)(Multicolor PALM)為人們提供了一種新的手段用來(lái)觀察膜蛋白集合、組織的過(guò)程,并且還能定量分析不同蛋白間的空間距離關(guān)系。因?yàn)橛辛薖ALM提供的單分子信息,人們就可以清楚地了解蛋白分子間的空間關(guān)系,甚至有可能計(jì)算出相隔某一距離的分子之間發(fā)生相互作用的可能性。
SR成像技術(shù)還能用于在單分子水平研究蛋白動(dòng)態(tài)組裝過(guò)程
細(xì)胞對(duì)外界刺激信號(hào)的反應(yīng)起始于胞膜,在胞膜上受體蛋白之間發(fā)生動(dòng)態(tài)的集合,用來(lái)調(diào)節(jié)細(xì)胞的反應(yīng)活性。像HIV這種有被膜病毒也是在細(xì)胞膜上完成病毒顆粒組裝過(guò)程的病毒,也是利用了細(xì)胞的物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制。盡管現(xiàn)在蛋白組裝的物理模型還遠(yuǎn)遠(yuǎn)沒有完成,但研究人員知道膜蛋白的動(dòng)態(tài)組裝過(guò)程是不均一的,所以通常使用熒光試驗(yàn)手段很難獲得分子水平上的信息。同樣,單分子測(cè)量技術(shù)(Single molecule measurements)也存在著類似的局限,因?yàn)閱畏肿訙y(cè)量技術(shù)只能觀察細(xì)胞內(nèi)的幾個(gè)分子,所以缺乏整體的信息。因此由于缺乏空間分辨率,很難動(dòng)態(tài)地研究蛋白質(zhì)組裝過(guò)程。SR熒光成像技術(shù)與活細(xì)胞成像技術(shù)和單分子示蹤技術(shù)(sptPALM)結(jié)合就能解決這一問(wèn)題。我們可以借助分子密度準(zhǔn)確地看出PALM圖像中的蛋白質(zhì)簇,蛋白質(zhì)簇動(dòng)態(tài)的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)和形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)能幫助我們了解蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)組裝的機(jī)制。